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蛋白质体外结合实验(GST pull-down 技术)_GST-pull down

蛋白质体外结合实验(GST pull-down 技术)_GST-pull down

GST-Pulldown是在体外验证两种蛋白质结合的方法之一,其原理是目的蛋白与GST融合表达,蛋白固定在谷胱甘肽(GSH)亲和树脂上,作为与目的蛋白亲和的支持物,起到“诱饵蛋白”的作用。目标蛋白溶液通过柱子,从中可以捕获相互作用的“捕获蛋白”(目标蛋白)。结合物洗脱后,通过蛋白质印迹(WB)分析证实了两种蛋白质之间的相互作用。“诱饵蛋白”和“捕获蛋白”都可以通过细胞裂解物、纯化蛋白、表达系统以及体外转录和翻译系统获得,这种方法简单易操作。实验操作流程如下:1.诱导与转化:将制备好的分别带GST和His标签的质粒转化至BL21感受态细胞中A.质粒加入细菌B.冰上30minC.42℃水浴5s或1minD.向转化混合物中加入500µLLB,不加抗生素,160rpm37℃摇床振荡1hE.涂板隔夜培养;pGEX用A板,pET用K板F.挑选阳性克隆(引物根据自己做的质粒选择)G.将阳性克隆加入至3mLLB培养液,220rpm37℃过夜小摇H.取200µL菌液加入20mLLB培养液(50mL离心管内),1:1000分别加入氨苄西林(pGEX)及卡那霉素(pET-28a)220rpm37℃4-6小时I.菌液呈浑浊状后检测OD值,OD值0.6时加入0.5mM的IPTG,继续摇菌4小时J.5000rpm离心10min后收集菌体,去除上清2.裂解细菌:A.向菌体中加入1mL含1x蛋白酶抑制剂的BC100缓冲液(不含TritonX-100)重新悬浮细菌。B.将步骤A中的菌体悬液转移至1.5mLEP管中,置于冰上。超声裂解细菌,超声30秒,冰上静置30秒,共反复5次。C.超声后加入110µL10%TritonX-100,4℃震荡1h。D.4℃,12000rpm离心30分钟。收集上清液。E.取20µL上清,加入loadingbuffer,煮蛋白后SDS凝胶电泳,以考马斯亮兰染色检测蛋白表达。留40µL裂解液作为input。3.GST融合蛋白的纯化:A.清洗beads:用含0.1%TritonX-100的BC100缓冲液洗20µLGST-sepharosebeads,5000rpm离心30秒2次,共清洗3次。B.重悬beads:以BC100缓冲液1:1重悬GST-sepharosebeads。C.孵育蛋白:将GST融合蛋白裂解液加入洗涤后的GST-sepharosebeads中。4℃震荡孵育1小时。D.收集beads:5000rpm离心30秒,两次,沉淀beads。E.清洗beads:吸出上清,用1mLBC500缓冲液(含1%TritonX-100,不含蛋白酶抑制剂)清洗beads3次。5000rpm离心30秒,两次,沉淀beads。F.清洗beads:以1mLBC100缓冲液(含0.1%TritonX-100,不含蛋白酶抑制剂)清洗beads3次。5000rpm离心30秒,两次,沉淀beadsG.以300µLBC100缓冲液重悬beads(含0.1%TritonX-100)。4.His融合蛋白的纯化:采用His-taggedproteinpurificationMagbeads(Absin,中国)进行His融合蛋白的纯化,按照制造商的使用说明进行操作。A.取0.3mL的磁珠,磁性分离,washingbuffer清洗3次。B.细菌裂解液加入磁珠中,4℃震荡孵育1小时,washingbuffer清洗3次,每次清洗后均磁性分离磁珠。C.在磁珠中加入400µLElutionbuffer,室温震荡2分钟,磁性分离收集洗液。反复3次。D.将3次中收集到的液体用10K的超滤管进行浓缩,5000g,离心15分钟,加入500µLBC100缓冲液进行缓冲液置换,5000g,离心15分钟,收集到50-100µL浓缩蛋白。5.蛋白结合及检测:A.纯化蛋白结合:向GST及GST-DNMT3Lbeads中分别加入10µLHis-USP46纯化蛋白,4℃震荡孵育1小时,5000rpm离心30秒,两次,沉淀beads。B.吸出上清。以1mLBC100缓冲液(含0.1%TritonX-100)清洗beads3次。C.加入1xloadingbuffer50µL,连同input样本,95℃金属浴5min。离心分离beads,取上清进行Westernblot检测。

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