设置原则是：一般情况下均使用毛细管柱，极性样品使用极性毛细管柱，非极性样品采用非极性毛细管柱，未知样品可先用中等极性毛细管柱，试用后再调整.当然，如果有文献可以参考，就采用文献所用条件!质谱条件包括：电离电压，电子电流，扫描速度，质量范围，这些都要根据样品情况进行设定!为了保护灯绿和倍增器，在设定质谱条件时，还要设置溶剂去除时间，使溶剂峰通过离子源之后再打开灯绿和倍增器！在所有的条件确定之后，将样品用微量注射器注入进样口，同时，启动色谱与质谱，进行GC-MS分析.

　　此种扫描方式是只针对选定的离子进行检测，而其它离子不被记录！它的优点：一是对离子进行选择性检测，只记录具有特征的、感兴趣的离子，不相关的，干扰离子统统被排除；二是选定离子的检测灵敏度大大提高。在正常扫描情况下，假定一秒钟扫描2～500个质量单位。那么，扫过每个质量所花的时间大约是1/500秒，也就是说，在每次扫描中，有1/500秒的时间是在接收某一质量的离子.在选择离子扫描的情况下，假定只检测5个质量的离子，同样，也用一秒，那么，扫过一个质量所花的时间大约是1/5秒！

　　不同的检测项目准确性稍有不同.通过PCR技术检测病毒，准确性基本上是全部；通过抽取玻璃体液，做眼弓蛔虫病检测，准确率也接近全部；文献报道，通过检测眼内液的白细胞介素10和白细胞介素6的比值，判断是否淋巴瘤的准确性是94%！实验室检测和其他检查手段一样，都是辅助诊断的。建议大夫和患者拿到实验室报告后，结合患者的病情、病史以及其它辅助检查，进行综合的诊断.各项检查都不能保证每次都是全部准确的，技术或机器的问题也可能影响检查结果！

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　　实验室检测主要是通过抽取眼内液进行检测，流程很简单！在做眼内液穿刺前，大夫会先给患者用一些抗生素类眼药水，每半小时滴一次，4~5次之后进行表面局麻.局麻也是通过滴眼药水的方式进行的，每五分钟一次，一般滴三次就够了.医生在显微镜下进行眼球穿刺抽取眼内液，大约0！1毫升即可.抽取后嘱咐患者还要用抗生素眼药水频繁滴眼，每半小时滴一次，一般持续到当天晚上就可以停药了.眼内液的实验室检测，标本，一是眼球的前房水，就是角膜和虹膜之间的液体；第二是抽取玻璃体液。

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　　通过基因芯片方法判断葡萄膜炎病因的检查，只要一个小时就可以出结果。其它比如炎症因子、新生血管调节因子的检查，一般要1到2个工作日完成！在理论上来说，进行眼内液穿刺可能会造成眼内组织的误伤，或细菌进入眼内引起炎症!如果是手术经验丰富的眼科大夫操作，风险还是比较低的!另外，穿刺前后会给患者滴抗生素眼药水，也是防止增加感染的几率！并且，穿刺是在眼科专用的裂隙灯（相当于显微镜）下进行，可以准确地掌握穿刺的部位和深度，使误伤的风险大大降低！

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　　并且计算机可以自动将每个质谱的所有离子强度相加！显示出总离子强度，总离子强度随时间变化的曲线就是总离子色谱图，总离子色谱图的形状和普通的色谱图是相一致的，它可以认为是是用质谱作为检测器得到的色谱图.质谱仪扫描方式有两种：全扫描与选择离子扫描全扫描是对指定质量范围内的离子全部扫描并记录,得到的是正常的质谱图,这种质谱图可以提供未知物的分子量和结构信息!可以进行库检索!质谱仪还有另外一种扫描方式叫选择离子监测（SelectionMoniringSIM）。

　　其摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制，在基因组水平解释微生物群体的多样性和丰度，探索微生物与环境及宿主之间的关系!目前，第二代高通量测序技术在宏基因组的研究上已被广泛应用！第二代高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点，加快了宏基因组测序在鉴定低丰度的微生物群落，挖掘更多基因资源方面的应用！质谱仪种类很多，不同类型的质谱仪主要差别在于离子源。离子源的不同决定了对被测样品的不同要求，同时，所得信息也不同。